เครื่อง MRI สามารถตรวจหาความผิดปกติของอวัยวะต่างๆในร่างกายได้ด้วยความไวที่สูง  สามารถเห็นโรคต่างๆได้ตั้งแต่ที่เริ่มก่อตัว  ทำให้สามารถรักษาได้อย่างทันท่วงที  ยกตัวอย่างเช่น มะเร็งชนิดต่างๆ หากสามารถตรวจพบและรักษาตั้งแต่ระยะเริ่มแรก  จะทำให้หายขาดได้  ดังนั้น ในปัจจุบันจึงมีโปรแกรมการตรวจร่างกายประจำปีโดยการใช้เครื่อง MRI  เครื่องมือนี้สามารถตรวจความผิดปกติของอวัยวะต่างๆของร่างกายได้เกือบทั้งหมด เช่น สมอง กระดูกสันหลัง ปอด หัวใจ และอวัยวะต่างๆในช่องท้อง (เช่น ตับ ไต ตับอ่อน รังไข่ และมดลูก) 

1. หลังจากเปลี่ยนเสื้อผ้าเป็นชุดเพื่อที่พร้อมสำหรับการตรวจ  ผู้รับการตรวจจะได้รับการพาเข้าสู่ห้องตรวจ
2. ผู้รับการตรวจจะนอนบนเตียงตรวจ และมีการทำเครื่องจับสัญญาณคลื่นแม่เหล็กมาวางบนร่างกาย  โดยน้ำหนักโดยรวมของเครื่องจับสัญญาณนี้ประมาณ 1 กิโลกรัม
3. ขณะตรวจ จะมีเสียงดังเป็นระยะๆ จะมีฟองน้ำอุดหู เพื่อลดเสียง
4. ผู้รับการตรวจนอนสบายๆ นิ่งๆ บนเตียงตรวจ และทำตามเสียงที่บอก เช่น ให้หายใจเข้าแล้วกลั้นใจ หรือว่าอย่ากลืนน้ำลาย
5. ระยะเวลาในการตรวจทั้งหมด 1 ชั่วโมง
6. แพทย์จะดูภาพที่ได้จากการตรวจ และรายงานในเบื้องต้นพร้อมคำแนะนำให้ผู้รับการตรวจทราบหลังจากที่ตรวจเสร็จ
7. รายงานผลอย่างเป็นทางการ จะได้รับการส่งไปให้ผู้ป่วยภายใน 1 อาทิตย์

1. เนื้องอก หรือมะเร็งที่เล็กที่สุดได้ประมาณ 0.4 ซม. หากเล็กกว่านี้จะไม่สามารถตรวจพบได้
2. ไม่สามารถตรวจหาโรคในบางอวัยวะได้  ดังนี้ ลำไส้ เต้านม ต่อมลูกหมาก ไทรอยด์ โรคมะเร็งเม็ดเลือดขาว และก้อนเนื้องอกที่มีขนาดเล็กมากๆ ตามแขน ขา  ดังนั้น อวัยวะเหล่านี้จะได้รับการตรวจเพิ่มเติมโดย

• ส่องกล้อง สวนแป้ง หรือกลืนแป้ง เพื่อตรวจดูกระเพาะอาหารและลำไส้
• ทำเอกซ์เรย์เต้านม (Mammography) เพื่อตรวจหามะเร็งเต้านม
• เจาะเลือด  เพื่อหาปริมาณ prostate specific antigen (PSA) เพื่อตรวจหามะเร็งของต่อมลูกหมาก
• ตรวจอัลตราซาวด์ต่อมไทรอยด์